汉阴县河流属长江流域汉江水系。境内流域面积在10平方公里以上的河流41条,10平方公里以下、1平方公里以上的河溪261条。除汉江、月河外,所有河流均呈南北走向,构成以汉江、月河为主干的叶脉状水系。源出巴山之水系不甚发育,四季常流、水量较丰的河仅富水河、牟梓河两条,其余多系小河溪和季节性河沟,河向北东,注入汉江。源出秦岭的水系极为发育,河流密度大,纵横交汇,蜿蜒南流。较长的河流有中河、青泥河、观音河、东沙河等4条,分别南注月河、池河。源出凤凰山之河流纵坡大,大多短而直,水流湍急,河床多巨石。南北分流,注入汉江、月河、池河。
汉江 为众水归槽之河。由石泉县石泉嘴入境,流经汉阳、漩涡两区7乡,过牟梓河口入紫阳县境。境内流程21.9公里,纳南北支流、溪沟19条,流域面积380.9平方公里,河床比降0.56‰。
月河 系汉江一级支流,发源于凤凰山主峰铁瓦殿北麓,横贯县境东西,为源于县境内的笫一大河。流经平梁、城关、蒲溪3区(镇)的12乡(镇),南收9条河(沟),北纳14条河(沟),由双乳乡黄龙洞流入安康县境。境内流程49.5公里,集水面积851.4平方公里,流量8.815立方米/秒,河床比降6.3‰。因其曲折平缓,形似弯月,故得名月河。
牟梓河 系汉江一级支流,发源于西乡县太白池东麓,经镇巴县流入县境,流经双坪、上七、梓龙乡。境内流程30公里,集水面积116.4平方公里,流量2.318立方米/秒,河床比降3.3‰。河道深狭曲折。
富水河 系汉江一级支流,发源于西乡县上高川,经石泉县流入县境,流经黎明、天池、汉阳乡。境内流程13.6公里,集水面积48.03平方公里,流量0.9立方米/秒,河床比降4.4‰。河道曲折深狭,水量丰沛。
观音河 系汉江二级支流,发源于秦岭南坡老鸦坑,流经药王、八庙、天星乡,在杨家坝口注入月河。流程35.76公里,集水面积97.65平方公里,流量1.015立方米/秒,河床比降14‰。河道迂回曲折。
洞河 系汉江二级支流,是源于本县境内的笫二大河,由上游青泥河、中河、沈坝河三条支流在三清观交汇后称洞河,又纳张山沟、王家河、姚湾沟、朱家沟、夏家沟诸水,于涧池镇军坝东侧注入月河。流经铁佛、蒲溪区9乡(镇),全长58.6公里,境内集水面积311.75平方公里,流量3.174立方米/秒,河床比降22.1‰。