位于今碑林区东仓门街,是碑林地区惟一的清真寺。 清康熙二十二年( 1683),于端履门以东,东大街以南至城墙的东南隅修筑汉军驻防城,是为南城。为适应南城驻军中的穆斯林教徒过宗教生活,修建了南城清真寺。南城清真寺属伊斯兰的老教,教徒遵守“念、礼、斋、课、朝”五项功课。寺院西部为三间礼拜殿,院中还有三间过厅、南北讲经堂及水房等,房舍不多,规模较小。 建国后,1958年宗教改革,由西安清真大寺的寺管会将该寺院租给新新社会福利制刷厂。1976年,又被碑林区委党校使用。中共十一届三中全会后,落实党的宗教政策,于1985年2月交回。经过重新修建,礼拜大殿殿顶飞檐挑角覆绿色琉璃瓦,古朴高雅。并修建了厢房及其他用房,使南城清真寺面貌焕然一新。