清同治年间(1862～1874)，伊斯兰教传入本县。1949年上半年，全县有教徒411人，其中阿訇1人。1988年，在普集镇新建一座“清真殡仪馆”，作为回民举行殡仪、礼拜及节日活动的场所。1987年成立武功县伊斯兰教协会。1990年，教徒主要分布在普集镇、武功镇、小村镇、长宁街以及中国人民解放军第5702、9929、477等地，全县有教徒250人，其中阿訇1人。

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